利用Illumina Long-read测序技术对人和小鼠脑组织进行转录组测序 

Michael P Snyder教授和他的团队的研究成果为首篇利用Illumina平台的Long-read测序技术进行转录组测序的文章，具有重大意义。

作者将Long-read测序的结果同先前的PacBio平台转录组测序结果进行比较，发现Long-read平台在测序时5‘端的碱基错误率低于PacBio平台的结果。

作者将本文的Long-read测序平台得到的平均读长进行统计，人脑样本的RNA平均长度为1,906bp，小鼠脑样本的RNA平均长度为1,849bp，均高于之前文章中利用PacBio平台对人转录组的测序长度。

此外，作者对测序结果中的同源异构体（isoform）做了分析，发现较多新的同源异构体，并对新的同源异构体在编码基因、lncRNA、假基因中的分布做了统计。对某些特定基因的同源异构体进行分析，发现存在内含子保留事件和长转录本的外显子跳跃事件。

最后，对交替外显子的分子关联做了分析，包括不同FDR值条件下的特有远端交替外显子的数量进行统计，以及对人和小鼠的远端分子关联外显子的保守性进行了分析。

与现有的Illumina、PacBio平台的转录组测序技术相比，Illumina long-read测序技术兼顾Illumina的测序深度大、PacBio平台读长长的特点，保证了表达量的正确性和转录本结构的正确性，为转录组测序的研究提供了更为可靠的技术手段。 

派森诺生物市场部整理 

原文检索：

Hagen Tilgner, Fereshteh Jahanbani, Tim Blauwkamp et al. Comprehensive transcriptome analysis using synthetic long-read sequencing reveals molecular co-association of distant splicing events. Nature Biotechnology 33, 736–742 (2015) doi:10.1038/nbt.3242